6.1 Archivo Histórico Documental Incháustegui Cabral

Contiene una valiosa colección de documentos relacionados, principalmente con la época colonial de La Hispaniola. Conserva unos 4,000 legajos, con más de 22,000 páginas, del período 1400-1890, recopilados por el historiador dominicano J. Marino Incháustegui Cabral en los Archivos Históricos de Indias y de Simancas, de España; más de 9,000 páginas de documentos recopilados por el historiador Don César Herrera, del período 1500-1865. Además, conserva otros fondos como libros, fotografías, firmas de Reyes y Gobernadores y una colección de los primeros periódicos dominicanos (1871-1916)

6.2 Fondos "Monseñor Hugo Eduardo Polanco Brito"

Contiene la biblioteca personal, el archivo personal, recortes de periódicos, documentos históricos y religiosos, y recuerdos personales de Monseñor Hugo Eduardo Polanco Brito, fundador y primer Rector de la Universidad, donados en testamento a la PUCMM. Esta colección contiene más de 5,000 volúmenes de libros y documentos valiosos. Está considerada como el centro mas completo para el estudio de la vida y obra de Mons. Hugo Eduardo Polanco Brito.

6.4 Herbario Rafael M. Moscoso

Cuenta con una colección de más de 25,000 especímenes e investigaciones de la flora autóctona de la Isla, dedicada principalmente a la investigación taxonómica de las plantas y el intercambio científico nacional e internacional. La conforman, además, la colección de libros especializados en botánica. La colección fue donada por el Dr. José de Jesús Jiménez Almonte, médico y botánico dominicano dedicado al estudio de la flora de la Hispaniola.

6.5 Publicaciones y Documentos PUCMM

Integrada Colección de libros, revistas y diferentes materiales bibliográficos editados por la PUCMM, así como los documetns producto de las actividades universitarias de los departamentos académicos o administrativos.